美军陆战1师在第1个星期的战斗中伤亡就达到4000人，不过日军的弹药并不充分，所以陆战1师仍然能够坚持，到了9月20日，美军陆战1师仍然在机场与日军对峙，美军上下都感到没办法。9月22日在帕劳主岛的日军第14师团决定向贝里琉派发援军，当天下午10时三十分第14师团步兵第15联队第3大队1个中队250人从主岛搭乘海上机动第1旅团输送队第1中队的6艘舟艇先行出发，23日上午5时竟奇迹般的冲过美军封锁线在贝里琉岛登陆成功，只伤亡了14人。9月23日晚8时30分第14师团步兵第15联队第3大队主力以及500名搬运工共计1200人携带大量补给物资前往贝里琉岛登陆，但中途被美军发现，日军携带的补给品全数被毁，只几百步兵携带少量弹药与贝里琉日军汇合。此后由于美军加强巡逻，帕劳主岛日军再也无法给予贝里琉岛任何支援了，但美军在贝里琉岛仍长期无进展。

由于贝里琉岛战役持续无进展，美军又在1944年9月23日把陆军第81师321团也投入了贝里琉岛，也就在这一天美军总算是占领了整个机场，但机场旁边的高地仍为日军控制，美军飞机仍然是在枪林弹雨里起飞着陆，离开跑道就丢炸弹。由于美军在登陆贝里琉岛之前，已经下达了放弃登陆帕劳的命令，尼米滋攻击帕劳群岛的作战等于是废弃了，美军最后执意夺取帕劳群岛，作战意图就变成了支援菲律宾作战的战役，利用夺取的帕劳群岛航空基地，为登陆莱特岛提供支援，但在贝里琉打成了僵局，别说什么支援莱特岛登陆了，这眼看这就要扯美军菲律宾战役的后腿了，美军大量的战舰与弹药被牵制在了佩里硫岛，成了个扯后腿的鸡肋，至于打帕劳主岛美军更是彻底失去了信心，想都不去想了，有趣的是当初进攻帕劳的战役，美军就命名为僵持行动，在佩里硫真的打成了僵持行动。

美军占领机场后打到10月仍无明显进展，美军陆战1师组织了一些攻势，取得了有限的进展，但脱离舰炮支援后又僵持住了，虽然日军又组织了大的反冲击一度打的美军陆战1师节节败退，但美军空前的海空火力支援，加上陆军81师321团的援助，最后还是帮助美军陆战1师稳住了防线，于是美军与日军进入拉锯状态，日军打不走美军，美军也奈何不了日军，这时的贝里琉战役真的成了扯美军后腿的战役，已经打乱了美军登陆莱特岛的计划，而到了10月中旬麦克阿瑟实在等不及了，决定不管贝里琉岛，把舰队撤了，并干脆宣布10月12日美军已经结束了贝里琉战役，并于10月20日发动了登陆莱特岛作战，这时关于贝里琉到底该怎么办，美军内部又起了争论，一部分人认为，贝里琉岛战役本来就是多余的，应该从贝里琉岛撤军，趁早结束这个早就被放弃了的战斗，但大部分人认为，贝里琉岛应该坚决打到底，因为为了这个岛美军已经付出了太大的伤亡代价，就这样结束，那么前面付出的所有牺牲与代价就全部浪费了。最后达成共识，这个战役或许根本就不应该去打，但既然已经付出了太大的代价，那么就不能白付，要用任何代价打到底是贝里琉的命运就这样被决定了。

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